La denominación antigua de la ciudad correspondía a la de la aldea otomí llamada Degnò o Iah – hiu; palabra, la primera, que los nahuatlacoso mexicas tradujeron a Amoles, o “raíz de jabón”.
El segundo nombre es de lengua Ñha – Ñhu (Con la que hablo, mi lengua materna). “Iah – Hiu”, significa: “pueblo que se asentó” o “lengua que se incrementa”.
A la llegada de los grupos españoles a la región, los mismos europeos fueron reorganizando a las antiguas aldeas en pueblos de indios, todo con el fin de lograr una explotación y la evangelización a la religión católica.
A la llegada de los grupos españoles a la región, los mismos europeos fueron reorganizando a las antiguas aldeas en pueblos de indios, todo con el fin de lograr una explotación y la evangelización a la religión católica.
Por las circunstancias que se fueron presentando y el crecimiento poblacional, de acuerdo a las leyes de la Nueva España impuestas por los reyes españoles el 9 de octubre de 1718 el virrey Don Baltazar Zúñiga y Valero duque de Arión firmó el acta para la fundación de este paraje de indios en Pueblo – Doctrina.
El día 5 de mayo de 1721 por órdenes del mismo virrey se lleva a cabo la ceremonia de facto que consistió en realizar una ceremonia religiosa y la colocación de una cruz de cantera en el lugar donde se construiría el templo además de que las autoridades comisionadas otorgaban a San José como su santo patrono llamándose a partir de esa fecha como San José de los Amoles.
El primer sacerdote oficialmente instituido fue Joseph Chavery, en 1739.
El 23 de septiembre de 1810 por la parte norte del poblado de San José de los Amoles pasa el ejército insurgente encabezado por el cura Don Miguel Hidalgo quien se trasladaba de la villa de Celaya a la Villa de Salamanca.
El día 16 de marzo de 1821 el coronel Luis Cortazar y Rábago da lectura al Plan de Iguala cumpliendo la orden de su jefe el General Agustín de Iturbide.
San José de los Amoles se independiza de Celaya en 1856 para formar una municipalidad.
. EL 21 de Octubre de 1857, el Gobernador del Estado, General y Licenciado D. Manuel Doblado eleva el poblado a la categoría de Villa cambiando su nombre de San José de los Amoles a Villa de Cortazar.
El nuevo nombre se compone de las raíces vascas: eskorta, corral y zahar, viejo: Literalmente el nombre de Cortazar significa: “Corral Viejo”.